Elektrophorese
Bei Schneider Laborplan erhalten Lehrerinnen und Lehrer sämtliche Geräte, Reagenzien und Puffer für die horizontale und die vertikale Elektrophorese
Die Elektrophorese ist eine biochemische Methode, bei der Biomoleküle, wie Nukleinsäuren und Proteine, in einem elektrischen Feld aufgetrennt werden. Als Trägermedium dient meist ein Gel, durch dessen Poren die Moleküle unterschiedlich schnell wandern können. Bei der Migration durch das Gel spielen dabei sowohl die Ladung als auch die Größe der Moleküle eine Rolle.
Kleine Moleküle können schneller durch engmaschige Poren wandern als große Moleküle und negativ geladene Moleküle wandern zur Anode, während positiv geladene Moleküle in Richtung der Kathode wandern. Zur Auftrennung von Biomolekülen kann im Wesentlichen zwischen zwei Arten der Elektrophorese unterschieden werden - der horizontalen und der vertikalen Elektrophorese.
Die horizontale Elektrophorese, oder auch Agarose-Gelelektrophorese, eignet sich besonders gut zur Trennung von Nukleinsäuren. Die Nukleinsäuren tragen eine negative Ladung und wandern daher alle Richtung Anode, lediglich die Größe und die Struktur der Fragmente bestimmt die Geschwindigkeit.
Die Agarose-Gelelektrophorese ist eine gängige Methode zur Überprüfung einer gDNA- oder RNA- Isolation, zur Detektion von PCR-Produkten, zur Überprüfung eines Restriktionsverdaus und zur DNA-Aufreinigung für die anschließende Klonierung oder Sequenzierung.
Die vertikale Elektrophorese, oder auch Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE) wird meist zur Trennung von Proteinen durchgeführt, sie eignet sich aber auch zur Trennung von Nukleinsäuren, oder für die Darstellung von Wechselwirkungen zwischen Protein und DNA.
Zur Auftrennung von Proteinen ist die gängigste Methode die SDS-PAGE - hier werden Proteine durch ein denaturierendes System der Größe nach aufgetrennt. In der nativen PAGE werden Proteine ihrer natürlichen Ladung und Faltung nach aufgetrennt. Die native PAGE eignet sich dadurch auch zur Analyse von Protein-Protein- und Protein-DNA-Interaktionen, oder auch für hochauflösende Nukleinsäuregele.
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